El género Azolla se encuentra presente en casi todo el mundo, excepto en regiones que cuentan con períodos largos de congelación o aridez. Muchas de sus especies tienen amplia distribución geográfica, por lo que el género está dividido en 2 secciones (subgéneros) y 6 especies, sobre la base de sus órganos reproductivos productores de esporas. Las secciones son:
Sección Rhizosperma:
- niolítica
- pinnata
Sección Azolla:
- filiculoides
- caroliniana
- mexicana
- microphylla
La especie Azolla filiculoides se encuentra desde el Norte de Estados Unidos hasta la Argentina, pasando por el Ecuador y desde el nivel del mar hasta a más de los 4.000 metros de altura.
En Bolivia la especie Azolla filiculoides se encuentra desde los bofedales alto-andinos hasta los humedales de la Amazonía. La cual ha sido identificada como principal especie de interés para el proyecto de Promoción del Uso de Azolla en Tarija, apoyado por la alcaldía de Floreffe en Bélgica.
Azolla para Todos 